O subfilo Saccharomycotina é uma linhagem do filo fúngico Ascomycota que apresenta níveis de diversidade genômica semelhantes aos de plantas e animais. A Saccharomycotina consiste em mais de 1.200 espécies conhecidas atualmente divididas em 16 famílias, uma ordem e uma classe. As espécies deste subfilo são ecológica e metabolicamente diversas e incluem importantes patógenos humanos oportunistas, bem como espécies importantes em aplicações biotecnológicas. Muitas características de interesse biotecnológico são encontradas em espécies intimamente relacionadas e frequentemente restritas a clados filogenéticos únicos. No entanto, o potencial biotecnológico da maioria das espécies de leveduras permanece inexplorado. Embora o subfilo Saccharomycotina tenha taxas muito mais altas de evolução da sequência do genoma do que seu subfilo irmão, Pezizomycotina , ele contém apenas uma classe em comparação com as 16 classes de Pezizomycotina . O terceiro subfilo de Ascomycota , o Taphrinomycotina , é composto por seis classes e possui aproximadamente 10 vezes menos espécies que a Saccharomycotina . Estes dados indicam que a classificação actual de todas estas leveduras numa única classe e numa única ordem é uma subestimação da sua diversidade. Nossas análises filogenéticas anteriores em escala genômica mostraram que a Saccharomycotina contém 12 clados filogenéticos principais e fortemente suportados; sete destas são famílias atuais ( Lipomycetaceae, Trigonopsidaceae, Alloascoideaceae, Pichiaceae, Phaffomycetaceae, Saccharomycodaceae , e Saccharomycetaceae ), uma compreende duas famílias atuais ( Dipodascaceae e Trichomonascaceae ), uma representa o gênero Sporopachydermia , e três representam linhagens que diferem em sua tradução de o códon CUG (CUG-Ala, CUG-Ser1 e CUG-Ser2). Usando essas análises em combinação com divergência evolutiva relativa e análises de conteúdo genômico, propomos uma classificação atualizada para Saccharomycotina , incluindo sete classes e 12 ordens que podem ser diagnosticadas pelo conteúdo do genoma. Esta classificação atualizada é consistente com os altos níveis de diversidade genômica dentro deste subfilo e é necessária para tornar a classificação mais elevada da Saccharomycotina mais comparável à de outros fungos, bem como para comunicar-se eficientemente em linhagens que ainda não foram formalmente nomeadas.
